皇帝刘存大怒之下，任命大将张辽为主帅，任命大将乐进和翟越为副帅，率领新编第五、第六、第七军共九万将士南征扬州，荆州牧刘表首鼠两端，坐观其变。
五月下旬，久无音讯的皇帝义子、原夷洲太守刘振忽然率领五万水师，乘坐数百艘巨型战舰，渡过海峡登陆吴越沿海，在东吴三大世家的倾力支持下，一举消灭孙权分布于吴越地区的反叛势力，与正在江北扬州鏖战的张辽所部九万将士南北呼应。
六月上旬，西路军曹操率部击败马超与韩遂十二万联军，一举拿下凉州，并将马腾残部赶往偏僻的羌族地区，占据河套地区的袁绍残部在投诚朝廷的黑山军猛烈攻击之下，逃亡西域。
七月下旬，张辽与乐进率部合围寿春，副将翟趋率领第七军三万将士，以迅雷之势越过寿春攻下濡须口，彻底断绝袁术叛军的退路。
七月二十七日黄昏，袁术在城破之际自刎身亡，麾下十万于众俯首投降，扬州自此纳入中央政权的管辖之中。
八月中旬，镇海将军刘振在损失两万将士和百余艘战舰之后，终于击败孙权、周瑜率领的东吴联军，一举占领东吴联军控制之下的最有一座坚城豫章，孙权和周瑜仅率三千残部逃往岭南。
同月下旬，幽州牧公孙瓒彻底消灭辽东地方势力，与副将赵云一起再接再厉，指挥十万将士乘胜北进攻伐乌桓，副将傅闿则率领本部三万精锐步骑掉头南下进攻三韩。
大汉三八一年，元月初一，大汉朝廷在洛阳祭祀天地，大朝。
彻底平复凉州得胜归来的车骑将军曹操，晋升丞相，大汉帝国史无前例的政治改革自此展开。
三月初五，荆州牧刘表在朝廷二十万大军压境之下，宣布辞去州牧职务，举家奔赴洛阳接受皇帝刘存的敕封，以亲王之尊悄然退出政治舞台，荆州自此纳入中央政权的直辖之内。
四月中旬，得胜回朝的夷洲太守、镇海将军刘振正式晋升亲王，封国变更为夷洲南面的吕宋大岛，在大汉水师八万将士配合下扫平三韩的大将傅闿被授予征东将军称号，三韩更名为东州，正式成为大汉帝国的第十四州。
大汉三八二年，元月，历时两年的全国平叛战争结束，大汉帝国除西域之外尽数纳入中央政权的管辖之内。
元月初九，大汉帝国开始了重要的政治体制改革，原三公九卿制度被五院九部所取代，大汉皇帝刘存除了依照《大汉宪法》掌控全国军队之外，将在未来十年之内逐步将国家行政权力交给以内阁为核心的中央政权，历任皇帝除了享有内阁大臣和各部主官的审核与任命权力之外，不再拥有干预内阁与中央议会的行政权力。
五院分别为承担行政职务的政务院、主管监察的都察院、主管国防军事的枢密院、主管宪政与律法的立法院和主管司法审判的大理院，五院权责分离，各司其职，各院主官均被任命为内阁大臣。
担任内阁首辅大臣的曹操兼任政务院大臣，行政院以下直辖九部分别为民政部、财政部、外交部、内务部、教育部、农业部、工业部、商业部、交通部。
其中，新成立的中央银行归属财政部管辖，与整合琅琊银行之后更名为皇家银行的皇室专有银行一样享有有货币发行权，大汉皇室除了拥有皇家银行和皇家专属领地珠山县之外，所有的山林河泽、矿区庄园等等全部转为国有财产。
大汉三九五年，积功升任大汉皇家军队首任元帅的太史慈率领三十万将士平定西域，大汉疆土尽数恢复鼎盛时期的规模，并增加了吕宋、兰芳等七个亲王属国，万国来朝之际，皇帝刘存昭告天下，正式将最高行政权力交给内阁和中央议会。
大汉四三五年，年近七旬的大汉皇帝刘存正式退位，太子刘泽继位，此时的大汉帝国人口增至四亿五千万，疆土东至东州，西抵葱岭，北逾北海，南至星洲海峡。
大汉四五〇年二月初二，大汉建文帝刘存携六岁的皇太孙刘岳于珠山造船厂出席大型蒸汽海轮下水典礼，万众欢呼之中忽闻怀中皇太孙不屑地低声骂了一句“傻逼才会为落后的蒸汽机欢呼”，惊愕之下刘存忽然病倒，对围绕身边的太史慈等十余心腹大将直言自己大限将至。
当晚午夜，年迈的大汉建文帝在百余子孙和四位终生相依的皇后和贵妃的哭泣声中，艰难地抬起手擦去哭得一塌糊涂的皇太孙刘岳的眼泪，含笑辞世。
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