每天吃饭前，必然要有人先给他试毒，但这样还是让朱由校不放心，如果是一些慢性毒药，吃得少又没什么反应的，试毒就没有任何效果。所以朱由校给尚膳监制定了一套非常严密的制度。
首先是闲人免进，但凡不是尚膳监的宫女太监，不能跨入尚膳监一步。不论白天还是夜晚，都有人值班看守。
尚膳监的御厨进出，也要进行搜身，防止带入什么毒药。
每天御厨做菜用的食材，都是必须先检查一遍，防止有人在食材供应环节中下毒。而下厨时所用的油盐酱醋，都由朱由校安排的几名太监一起将其封存，要用的时候再取出。
御厨下厨期间，也有人在边上监视，防止被人趁机下毒，而在呈上餐桌的过程中，也是全程监视。
反正能被下毒的环节，都进行了预防。
如此严密的制度，自然让御厨们有些提心吊胆。不过熟悉了一段时间之后，便逐渐适应了，并且十分认真的配合。主要还是朱由校提高了御厨们的待遇，只要是尚膳监的太监，俸禄都比其他部门要高，特别是尚膳监的主厨，一个月的俸禄高达三百两银子，帮厨每个月也有一百两的俸禄。
御厨们收入高了，自然不会被人收买。同时皇帝每次吃饭，就算是不合口味，也是和颜悦色的给他们提意见，感觉好吃的时候，还会褒奖几句，并给些赏赐。这让御厨们对皇帝产生了由衷的拥戴，自然不希望皇帝被毒死，下厨的时候都是仔细检查、全神贯注。
日常起居方面，则依旧是客氏负责。客氏把他带大，自然不可能害他，所以朱由校比较放心。
一番动作过后，宫内的隐患已经肃清了不少。
朱由校觉得，自己是该把军权抓一抓了，枪杆子里出政权嘛！有了军权才是最大的保障。于是朱由校决定对亲军进行巡视，于是让李进忠去调查了一下亲军情况。
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